Основные различия между простыми и сложными методами окраски бактерий:

1. При простой окраске используют один краситель, который прокрашивает всю клетку. 13 Это даёт возможность чётко определить формы и размеры клеток. 3
2. Сложные методы предусматривают применение двух или нескольких красителей. 13 Они состоят из нескольких этапов химической или физической обработки препаратов и позволяют дифференцировать одни микроорганизмы от других, идентифицировать отдельные элементы в пределах бактериальной клетки, а также отличить клеточный или тканевый фон препарата от содержащихся в нём бактерий. 5

Таким образом, простые методы дают общее представление о величине, форме, локализации и взаимном расположении отдельных клеток, но с их помощью нельзя установить структуру микробов и их дифференцированное отношение к красителям. 6 Сложные методы позволяют выявить наличие (или отсутствие) отдельных структурных элементов и некоторых органических соединений клетки, чем и определяют тинкториальные свойства каждого вида микроба. 7