Некоторые различия между корневой системой индоевропейских и афразийских языков:

• Сложность структуры корней: корневые морфемы исторических индоевропейских языков, в основном, односложны. 2 В афразийских языках, как минимум, большинство полнозначных корневых морфем двусложны и включают не менее двух полных слогов и не менее трёх консонантных элементов. 2
• Количество согласных: в индоевропейских языках в начале слова согласных не меньше, чем в его середине или в конце (консонатизм). 5 В афразийских языках на более позднем этапе из-за словосложения, лексикализации аффиксов и заимствований возникло большое число вторичных корней с числом согласных более двух. 3
• Фонемы: в праиндоевропейском языке в качестве фрикативной (щелевой) согласной были фонемы Ф, С, З. 5 Шипящий (Ш) был не таким выраженным, как у хамитов, семитов и других восточных этносов. 5 В афразийских языках для фонологической системы характерно троичное противопоставление согласных: глухой — звонкий — «эмфатический». 3
• Гласные: в древних индоевропейских конструкциях редко применялись сдвоенные открытые твёрдые гласные (АА, ОО, ЭЭ). 5 В афразийских языках есть богатая система производных глагольных основ — пород, которые образуются путём редупликации, а также присоединением аффиксов t-, n- или m-, s- (в праафразийском языке, видимо, sh-), -а. 3