Некоторые основные принципы функционирования наномашин (молекулярных машин):

• Преобразование различных видов энергии (световой, тепловой, электрической, химической и др.) в механическую энергию, что приводит к совершению определённой работы. 1
• Использование периодических воздействий для генерации направленного движения в желаемом направлении с контролируемой скоростью. 2
• Работа на основе случайностей. 3 Например, наномашина может вылавливать полезные движения, происходящие в тепловом хаосе, и отсекать ненужные, используя возможности, предоставляемые окружающей обстановкой. 3
• Использование молекулярного ассемблера (наноассемблера). 1 Это устройство способно манипулировать атомами и молекулами и создавать молекулярные машины по заранее вводимому плану. 1