Основные отличия технологии секвенирования Illumina от технологии PacBio:
- Illumina специализируется на коротких последовательностях, в то время как PacBio фокусируется на длинных. bridgeinformatics.com
- Illumina секвенирует небольшие фрагменты ДНК длиной 50–300 пар оснований, которые затем собираются в последовательность всего генома с помощью биоинформатических конвейеров и эталонных геномов. bridgeinformatics.com
- PacBio использует технологию длинного секвенирования HiFi, которая даёт последовательности длиной более 10 000 пар оснований. bridgeinformatics.com Преимущество длинных последовательностей — более простая сборка генома и высокая точность при идентификации редких вариантов и чётком выделении повторяющихся последовательностей. bridgeinformatics.com
Кроме того, Illumina предназначена для высокопроизводительного секвенирования и может анализировать миллионы фрагментов ДНК одновременно, в то время как PacBio секвенирует длинные фрагменты в реальном времени, читая основания по одному. mynucleus.com