Основные отличия между доминантным и рецессивным эпистазом:

1. При доминантном эпистазе проявление гипостатичного гена подавляется доминантным эпистатичным геном. 1 В качестве ингибитора выступает доминантный ген. 4
2. При рецессивном эпистазе рецессивный аллель эпистатичного гена в гомозиготном состоянии подавляет аллели гипостатичного гена. 1 В качестве ингибитора выступает рецессивный ген. 4

Кроме того, при доминантном эпистазе расщепление по фенотипу может происходить в соотношениях 12:3:1, 13:3, а при рецессивном эпистазе — 9:3:4, 9:7. 13