Некоторые ограничения коэффициента детерминации как показателя точности модели:

• Некорректность сравнения моделей с разным количеством факторов. 23 Значение коэффициента детерминации увеличивается при добавлении в модель новых переменных, даже если они не имеют отношения к объясняемой переменной. 24
• Отсутствие причинно-следственной связи между переменными. 4 Высокие значения коэффициента детерминации ещё не говорят о причинно-следственной связи. 4 Например, если объясняемая переменная и факторы, не связанные с ней, имеют возрастающую динамику, то коэффициент детерминации будет достаточно высок. 2
• Возможность искажения значений. 5 Коэффициент детерминации может быть искажён из-за выбросов в данных или наличия специфических значений. 5
• Зависимость интерпретации от метода расчёта. 5 Один и тот же коэффициент детерминации может иметь разные интерпретации в зависимости от метода расчёта. 5 Например, в случае использования нелинейных моделей, значение коэффициента детерминации может не иметь классической вероятностной интерпретации. 5

Для учёта этих ограничений используют скорректированный коэффициент детерминации, который как бы штрафует за каждый дополнительно включенный в расчёт фактор. 4