В чем заключаются ключевые различия между информационными системами базового и регионального уровней?

Возможно, имелись в виду различия между информационными системами федерального и регионального уровней.

Информационные системы (ИС) федерального уровня решают задачи информационного обслуживания аппарата административного управления и функционируют во всех регионах страны. eor.dgu.ru Такие системы создаются на основании федерального закона или акта федерального государственного органа. bigenc.ru

Региональные ИС предназначены для решения информационных задач управления административно-территориальными объектами, расположенными на конкретной территории. eor.dgu.ru Такие системы создаются на основании законов субъектов или акта регионального государственного органа, могут работать в нескольких муниципальных образованиях и/или подведомственных и иных организациях. bigenc.ru

Таким образом, ключевое различие заключается в территориальном масштабе: федеральные системы охватывают всю страну, а региональные — конкретную территорию.