Ключевые различия между аэробным и анаэробным типами окисления микроорганизмов заключаются в потреблении кислорода и в процессах получения энергии. 13

Аэробные микроорганизмы нуждаются в свободном доступе кислорода воздуха для дыхания. 1 Он необходим им для роста, развития и размножения. 3 В аэробных условиях процесс окисления идёт до конца — до образования диоксида углерода и воды с выделением большого количества свободной энергии. 2

Анаэробные микроорганизмы получают энергию для дыхания за счёт расщепления питательных веществ без доступа кислорода воздуха, то есть в процессе брожения. 1 Для этого им необходимы марганец, сера, кобальт, азот, металл или железо. 3 В анаэробных условиях вещество разлагается только до промежуточных продуктов, представляющих собой сложные органические соединения (спирты, органические кислоты). 2 Заключённая в них энергия не используется микробами, а образовавшаяся в небольших количествах энергия выделяется в окружающую среду. 2

Таким образом, аэробные микроорганизмы требуют богатых кислородом сред, а анаэробные — среды, в которых отсутствует кислород. 3