Некоторые ключевые отличия различных вариантов строения кинетопласта:
- Про-кДНК. 14 Кинетопласт представляет собой вытянутую структуру, похожую на пучок нитей. 14 Лишь небольшой процент молекул зацеплен друг за друга, при этом мини- и максикольца находятся в расслабленном состоянии. 14
- Поли-кДНК. 14 Кинетопласт не представляет собой единого тельца, а распределён в виде отдельных скоплений ДНК по всему матриксу митохондрии. 14 Содержит мало сцепленных колец и не содержит суперскрученных. 14
- Пан-кДНК. 14 Содержит небольшой процент сцепленных колец, но может содержать суперскрученные миникольца. 1 Распределена диффузно по всему матриксу митохондрии. 1 Занимает почти весь митохондриальный матрикс, а не разбросана по нему в виде отдельных скоплений. 24
- Мега-кДНК. 1 Распределена равномерно по матриксу митохондрии, при этом не содержит миниколец. 1 Последовательности, сходные с таковыми миниколец других кинетопластов, тандемно объединены в более крупные молекулы, длиной около 200 000 пар оснований. 1
Вариации структуры кинетопласта могут отражать филогенетические связи внутри кинетопластид. 23