Некоторые ключевые отличия между экто- и эндомикоризой:

• Структура. 4 При эктомикоризе гифы гриба образуют мантию вокруг корня растения и сетку Хартига внутри коры корня, но не проникают в клетки корня. 4 При эндомикоризе гифы проникают в клетки корня и образуют арбускулы, везикулы и спирали внутри клеток корня. 4
• Растение-хозяин. 4 Эктомикориза обычно встречается в корнях таких деревьев, как сосна, ель и дуб. 4 Эндомикориза типична для кустарничков (брусники, черники, вереска) и многих трав. 1
• Грибковый партнёр. 4 Эктомикориза образуется между грибами из семейства Basidiomycota и Ascomycota и корнями растений. 4 Эндомикориза образуется между грибами из семейства Glomeromycota и корнями растений. 4
• Обмен питательными веществами. 4 В эктомикоризе гриб-партнёр обеспечивает растение питательными веществами, такими как фосфор, азот и сера, в обмен на сахара, образующиеся при фотосинтезе. 4 В эндомикоризе гриб-партнёр обеспечивает растение питательными веществами, такими как фосфор и вода, в обмен на сахара, образующиеся при фотосинтезе. 4