Некоторые ключевые отличия между молекулярными и морфологическими методами в филогенетике:

Объект исследования:

• Морфологические методы основаны на сравнении сходств и различий в строении организмов. 1 Изучают гомологичные и аналогичные органы, рудименты и атавизмы. 12
• Молекулярные методы предполагают анализ молекулярных данных, таких как ДНК, РНК и белки. 3 Сравнивают последовательности генов, чтобы получить сведения об эволюционных взаимоотношениях организмов. 1

Источник данных:

• Морфологические методы используют несколько десятков признаков. 4
• Молекулярные методы содержат множество данных, которые можно использовать в расчётах, — в генах могут содержаться сотни нуклеотидов. 4

Объективность:

• Морфологические методы могут быть субъективными, так как разные люди могут трактовать и кодировать морфологические признаки по-разному. 4
• Молекулярные методы считаются более объективными, так как нуклеотиды всегда одинаковы. 4

Применение:

• Морфологические методы более достоверны при работе с таксонами высоких рангов, чем на уровне видов. 4
• Молекулярные методы можно использовать как для анализа групп высоких рангов, так и для выяснения отношений между видами и даже между отдельными индивидами. 4

Таким образом, молекулярные методы фокусируются на изучении последовательностей ДНК и белков, а морфологические методы — на сравнении внешних признаков организмов. 110