Некоторые ключевые отличия между естественной и агроэкосистемами:

• Направление отбора. 1 В природных экосистемах действует естественный отбор, а в агроэкосистемах — преимущественно искусственный, направленный на повышение урожайности сельскохозяйственных культур. 1
• Источник энергии. 14 Для естественной экосистемы единственным источником энергии является Солнце, а в агроэкосистемах помимо солнечной энергии используется дополнительная энергия, вносимая человеком (минеральные и органические удобрения, химические средства защиты растений и т. п.). 2
• Видовое разнообразие. 14 В агроэкосистемах резко снижено видовое разнообразие живых организмов: на полях обычно культивируют один или несколько видов (сортов) растений, что приводит к значительному обеднению видового состава животных, грибов, бактерий. 1
• Баланс питательных элементов. 1 В естественных экосистемах он практически замкнут: растения своими корнями забирают из почвы минеральные соли, затем растения поедаются консументами, разрушаются редуцентами, и соли возвращаются назад в почву. 3 В агроэкосистемах круговорот незамкнутый, он нарушен: человек изымает весь урожай и искусственно поддерживает плодородие почвы с помощью удобрений. 4