Ключевые отличия цис- и транс-положения генов заключаются в расположении доминантных аллелей в хромосомах: 1

• При цис-положении доминантные аллели генов находятся в одной хромосоме, а рецессивные — в другой. 1
• При транс-положении в хромосоме располагаются доминантный аллель одного гена и рецессивный — другого. 1

Также цис-элементы — регуляторные элементы, находящиеся на той же молекуле ДНК, что и регулируемый ими ген, а транс-элементы — на другой молекуле ДНК, не на той, которая несёт регулируемый ген. 3

Эти понятия используются в генетическом анализе, например, при проведении цис-транс-теста, который позволяет определить принадлежность двух рецессивных мутаций к одному или разным генам. 24