Ключевые отличия между аэробными и анаэробными методами культивирования заключаются в потребностях микроорганизмов в кислороде. 25

Культивирование аэробных микроорганизмов проводят:

• На поверхности плотных сред или в тонком слое жидких сред, когда микроорганизмы получают кислород непосредственно из воздуха. 2
• В жидких средах (глубинное культивирование). 2 В этом случае микроорганизмы используют растворённый в среде кислород. 2 Для обеспечения роста аэробных бактерий в толще среды требуется постоянное аэрирование. 2

Культивирование анаэробных микроорганизмов более сложно, так как должен быть сведён до минимума контакт микроорганизмов с молекулярным кислородом. 2 Для создания анаэробных условий используют различные приёмы: физические, химические и биологические. 2 Все они основаны на том, что микроорганизмы культивируют в каком-то замкнутом пространстве. 2