Ключевые отличия теории функциональных систем от классической рефлекторной теории:

1. Детерминация поведения. 1 В теории функциональных систем поведение живых существ определяется не только внешними стимулами, но и внутренними потребностями, генетическим и индивидуальным опытом. 1
2. Опережение реальных результатов поведения. 1 Это позволяет сравнивать реально достигнутое с запланированным на основе прошлого опыта и корректировать поведение. 1
3. Акцент на результатах действия. 78 Если рефлекторные реакции всегда определяются стимулами и завершаются ответными действиями, то в теории функциональных систем акцент сделан на результатах действия, полезных для метаболизма и адаптации живых организмов к условиям их существования. 7
4. Линейное распространение информации. 8 Рефлексы основаны на линейном распространении информации от рецепторов к исполнительным органам через центральную нервную систему, а функциональные системы представляют собой самоорганизующиеся нелинейные системы, состоящие из синхронизированных распределённых элементов. 8