Главные различия между катагенезом и арогенезом заключаются в направлениях эволюционного развития организмов: арогенез связан с усложнением организации, а катагенез — с её упрощением. 14

Арогенез — путь достижения биологического прогресса, связанный с формированием крупных, принципиально новых приспособлений, которые существенно повышают уровень организации живых организмов. 1 Арогенез приводит к появлению крупных систематических групп — царств, отделов (типов), классов. 1 Примеры: возникновение млекопитающих, плоских червей. 1

Катагенез — путь эволюции, при котором биологический прогресс организмов достигается за счёт упрощения их организации. 1 Некоторые органы и функции организма, которые были необходимы предкам, утрачивают своё первоначальное биологическое значение и подвергаются редукции вплоть до полного исчезновения. 1 Несмотря на упрощение своей организации, организмы, идущие по пути катагенеза, становятся более приспособленными к условиям среды обитания, что и обусловливает их биологический прогресс. 1 Примеры: переход двустворчатых моллюсков к малоподвижному донному образу жизни, переход ряда червей к паразитизму. 1