Значимость рецессивного эпистаза в генетике заключается в том, что он позволяет рецессивной аллели гена-супрессора угнетать проявление любой из аллелей другого гена. 1

Например, при рецессивном эпистазе гены, определяющие окраску шерсти у мышей, взаимодействуют друг с другом таким образом, что если в одном локусе имеется рецессивная мутация, то пигментация исчезает полностью, независимо от того, какими аллелями представлен ген. 2

Также примером рецессивного эпистаза может служить бомбейский феномен у человека. 2 У людей, гомозиготных по гену FUTI, экспрессия генов, кодирующих ферменты образования агглютиногенов (антигенов) эритроцитов A и B, нарушается, и на эритроцитах вместо нормальных антигенов A и B образуются дефектные. 2 Такие люди имеют группу крови 0 независимо от аллелей генов, определяющих группу крови по системе AB0, так как не имеют ни антигена A, ни антигена B. 2