Значимость доменной структуры в эволюции белков заключается в том, что она выступает в качестве строительных блоков. 1 Домены могут рекомбинироваться в различных конфигурациях для создания белков с различными функциями. 1

Кроме того, доменная структура упрощает процесс укладки макромолекулы в пространстве при формировании третичной структуры белка. 3 Это происходит благодаря тому, что формирование отдельных доменов протекает независимо друг от друга. 3

Также филогения последовательностей доменов позволяет реконструировать родственные отношения между ними и предположить, в каких узлах произошло изменение архитектуры. 5

Кроме того, динамика белковых доменов играет ключевую роль во множестве процессов молекулярного распознавания и передачи сигналов. 1