Значение кроссинговера в современной науке заключается в следующем:

• Увеличение комбинативной изменчивости. 12 Это даёт материал для естественного отбора и повышает наследственную изменчивость, которая даёт широкие возможности адаптации организма в различных условиях среды. 4
• Картирование генов. 3 На основе частот кроссинговера можно судить о взаимном расположении генов и расстоянии между ними, то есть картировать гены. 3
• Получение вариантов комбинаций для селекционной работы. 4 Человек специально проводит гибридизацию с целью получения необходимых вариантов комбинаций для использования в селекционной работе. 4

Таким образом, кроссинговер играет важную роль в процессе эволюции и позволяет получать разнообразный генетический материал для селекции.