Вклад Карла Вёзе в развитие современной классификации живых организмов заключается в создании трёхдоменной системы. 2 В ней все царства органического мира объединены в три домена, разделение основано на генетическом сходстве и различии: 2

1. Домен археи. 2 Включает архебактерий. 2
2. Домен прокариоты. 2 Включает настоящих бактерий. 2
3. Домен эукариоты. 2 Включает 4 из 5 типов царств животных, растений, грибов и протистов. 2

Кроме того, Вёзе внёс вклад в изучение рибосом. 1 Он предложил использовать нуклеотидные последовательности РНК для определения их вторичной структуры. 1 Анализируя вторичную структуру 16S и 23S рРНК, учёный с сотрудниками обнаружил фрагменты, консервативные во всех организмах, что позволило предположить «скелетную» функцию рРНК в строении рибосомы. 1

Ещё один вклад Вёзе — использование секвенирования для изучения природных микробных популяций. 1 Комбинирование филогенетического секвенирования РНК и ПЦР-амплификации ДНК позволило идентифицировать микроорганизмы в любых местах обитания, без привязки к лабораторному культивированию. 1