Теоретическая основа биостратиграфии заключается в законе соответствия флоры и фауны Гексли. 1 Он предполагает, что слои, в которых содержатся ископаемые остатки одинаковых видов живых организмов, имеют одинаковый возраст. 1

Также одним из важнейших оснований биостратиграфии является дарвиновский принцип монофилетического происхождения видов и их неповторимости в развитии органического мира. 4