Сложности определения видов-двойников на практике заключаются в морфологическом сходстве таких организмов. 1 Они образуются в процессе эволюции и отличаются только по генетическим признакам, то есть имеют разный хромосомный набор (число, форма, окрашивание хромосом). 1

Например, к видам-двойникам относятся бабочка данаида-монарх и бабочка вице-король: в отличие от вице-короля у монарха присутствуют рыжие пятна на краях верхних крыльев и ряд белых пятен, а по чёрной кайме обоих крыльев идёт тройной ряд белых точек, у вице-короля он двойной. 1

Также сложность заключается в том, что виды-двойники могут находиться в начале процесса микроэволюции, то есть образования нового вида, и выраженные морфологические особенности ещё не накопились. 2