Сложности морфологического анализа служебных частей речи могут заключаться в следующем:

• Тесная связь общего значения и функции в предложении. 1 При разборе нужно сразу указывать, для чего предназначено слово. 1
• Непростота различения деепричастий, наречий, предлогов, союзов и частиц. 1 Они часто образуются друг от друга, и в предложениях их бывает непросто различить. 1
• «Морфологическая омонимия» производных предлогов и союзов. 5 Например, «в течение месяца» и «в течении реки», «мал, зато (=но) удал» и «не за то волка бьют, что сер…». 5

Также сложность может возникать из-за большого количества признаков, которые нужно указать при разборе, например, союзов (простые и составные, производные и непроизводные, одиночные или повторяющиеся, сочинительные или подчинительные). 14