Роль субстрата в процессе биодеградации заключается в том, что он служит источником энергии и питательных веществ для микроорганизмов, которые участвуют в этом процессе. 25

Например, в процессе компостирования органический субстрат претерпевает физические и химические превращения с образованием стабильного гумифицированного конечного продукта, который может использоваться в сельском хозяйстве как органическое удобрение или средство, улучшающее структуру почвы. 2

Также роль субстрата может заключаться в том, что при его расщеплении высвобождаются простые химические соединения, которые в дальнейшем утилизируются как самими микроорганизмами, так и высшими растениями. 1

Важными параметрами субстрата в процессе биодеградации являются соотношение углерода и азота, а также мультидисперсность, необходимая для нормальной аэрации. 2