Роль принципа комплементарности в формировании вторичной структуры белков заключается в том, что он обеспечивает специфичное связывание лигандов в активном центре белка. 1

В активном центре связываются только те вещества (лиганды), которые соответствуют уникальным свойствам активного центра: по размеру, форме, расположению зарядов. 1 Между функциональными группами лиганда и центра связывания образуются нековалентные (водородные, ионные, гидрофобные), а также ковалентные связи. 3

Таким образом, комплементарностью лиганда и центра связывания объясняется высокая специфичность (избирательность) взаимодействия белок — лиганд. 3

Кроме того, принцип комплементарности используется на этапе транскрипции, когда информационная (матричная) РНК собирается на одной из нитей ДНК. 2