Роль палиндромов в структуре нуклеиновых кислот заключается в следующем:

• Формирование вторичной структуры. 13 Одноцепочечный палиндром может образовывать двухцепочечные структуры — шпильки, а палиндромные участки в двухцепочечных молекулах нуклеиновых кислот могут формировать крестообразные структуры, в которых каждая из цепей образует шпильки. 2
• Обеспечение процессов терминации транскрипции. 12 Это окончание синтеза белка. 1
• Место связывания регуляторных белков. 12 Например, репрессоров. 2
• Формирование некоторых типов нуклеиновых кислот. 1 Например, в случае транспортных РНК палиндромные последовательности образуют петли (в том числе центральную) тРНК. 1