Роль малых регуляторных РНК в генной экспрессии заключается в следующем:

• Подавление экспрессии гена. 1 Это происходит в результате комплементарного соединения малой интерферирующей РНК с мРНК, подлежащей трансляции, и разрушения последней рибонуклеазами. 1
• Поддержание стабильности генома. 1 Эта функция сохранилась почти повсеместно. 1
• Защита от РНК-вирусов. 1 В чистом виде сохранилась у растений, элементы обнаружены у C. elegans, D. melanogaster и позвоночных. 1
• Время-разрешённая и тканеспецифичная регуляция экспрессии генов. 1 Например, у организмов с билатеральной симметрией. 1

Также малые регуляторные РНК могут осуществлять позитивную регуляцию трансляции мРНК. 2 Прямая регуляция происходит за счёт открытия доступа рибосом к старт-кодону или за счёт изменения процесса редактирования мРНК, что приводит к повышению её стабильности. 2