Роль коферментов в процессах клеточного дыхания заключается в том, что они участвуют в транспорте электронов и протонов от окисляемого субстрата на кислород. 1

Например, кофермент Q (убихинон) служит высокомобильным переносчиком электронов между флавопротеинами и цитохромами цепи переноса электронов. 2 Кофермент НАД (никотинамидадениндинуклеотид) выступает переносчиком водорода в реакциях дегидрирования, где отщепляемый водород используется для восстановления кофермента. 3

Также молекулы коферментов являются окислителями (акцепторами электронов) при взаимодействии с предшествующими молекулами и восстановителями (донорами электронов) при взаимодействии со следующей молекулой цепи. 2