Роль естественного отбора в синтетической теории эволюции заключается в том, что он выступает главным направляющим фактором эволюции. 1

Естественный отбор — это выживание и размножение наиболее приспособленных к данным условиям обитания особей. 2 Он направляет эволюцию популяции в сторону наилучшего приспособления к среде. 2

В результате естественного отбора у популяций и видов появляются адаптации к среде обитания, происходит видообразование (на уровне микроэволюции) и возникновение более крупных таксонов (на уровне макроэволюции). 2

Естественный отбор может быть направлен как против определённых аллелей, так и определённых генотипов (сочетаний аллелей и генов). 2 Он уничтожает сочетания генов, которые будут затруднять жизнедеятельность и размножение организмов в условиях внешней среды, и сохраняет сочетания, которые в дальнейшем рекомбинируются и тестируются отбором. 4