Роль белков-шаперонов в процессе восстановления белковых структур заключается в следующем:

• Предотвращение случайных взаимодействий в белковой цепи. 2 Шапероны узнают участки белковой молекулы, которые скрыты в зрелой конформации, но легко доступны при её синтезе. 2 Обратимо связываясь с этими участками, шапероны позволяют молекуле укладываться только таким образом, который обеспечивает формирование нативной структуры. 2
• Участие в восстановлении нативной структуры частично денатурированных белков (рефолдинг). 3 Шапероны способствуют разрушению агрегата и рефолдингу белковой макромолекулы. 3
• Участие в удалении из клетки повреждённых молекул. 2 При нарушении структуры белка, например при воздействии высокой температуры, меняется его конформация. 2 При этом открываются те же области (обычно гидрофобные), которые во время синтеза были доступны для шаперонов. 2 Эти области становятся маркерами, позволяющими выявить повреждённый белок и отметить его для деградации. 2