Роль архебактерий в поддержании стабильности экосистем заключается в следующем:

• Участие в круговороте веществ. 5 Архебактерии вторично используют углерод, азот и серу в своих различных средах обитания. 5 Например, они осуществляют многие этапы круговорота азота, включая реакции, удаляющие азот из экосистемы (азотное дыхание и денитрификация), и процессы, в ходе которых азот поглощается (усвоение нитратов и фиксация азота). 5 В круговороте серы архебактерии, живущие за счёт окисления соединений серы, получают их из каменистых пород и делают доступными для других организмов. 5
• Трансформация органических остатков. 1 Почвенные архебактерии выступают агентом трансформации органических остатков, мобилизуют и иммобилизуют макро- и микроэлементы, контролируя их биогеохимический круговорот. 1
• Поддержка продукционного потенциала наземных экосистем. 1 Это происходит благодаря симбиозам и ассоциациям с растениями. 1
• Биоремедиация. 3 Определённые виды архебактерий способны разлагать загрязняющие вещества и токсины, предлагая потенциальные решения для очистки окружающей среды. 3