Регуляторная роль энхансеров и промоторов при транскрипции генов заключается в следующем:

1. Энхансеры — участки ДНК вне промотора. 3 Они связываются с различными факторами транскрипции и усиливают транскрипцию определённых генов. 3 Энхансеры могут располагаться на расстоянии до 10 тпн от промотора, а также после него. 3
2. Промоторы — это элементы ДНК, которые могут связывать РНК-полимеразу и другие белки для успешной инициации транскрипции непосредственно перед геном. 1 Промоторы определяют место начала транскрипции. 5

Таким образом, энхансеры контролируют программы экспрессии генов, специфичных для клеточного типа, чаще всего путём прохождения больших расстояний, чтобы оказаться в физической близости от промоторов своих генов-мишеней. 1 Промоторы же обеспечивают место присоединения РНК-полимеразы для запуска активной транскрипции. 2