Разница между приставочными глаголами «прибывать» и «пребывать» заключается в их значениях:

• Глагол «пребывать» означает «быть», «находиться», «оставаться». 1 Например: «я пребываю в городе», «он пребывает в шоке». 2
• Глагол «прибывать» имеет три значения: приходить или приезжать куда-либо, быть доставленным, поступать куда-либо (о вещи), увеличиваться, прибавляться (по количеству, объёму, величине и т. п.). 2 Например: «поезд прибывает на станцию», «посылка прибывает на почту», «вода всё прибывает и прибывает». 2

Таким образом, приставка «пре-» пишется, когда речь идёт о местонахождении, присутствии, состоянии, а приставка «при-» — когда речь идёт о прибытии, приближении. 5