В чем заключается разница между прикладными и теоретическими аспектами онтологии?

Возможно, имелись в виду различия между прикладными и формальными аспектами онтологии.

Формальная онтология исследует наиболее абстрактные характеристики объектов. en.wikipedia.org Онтология как раздел философии изучает фундаментальные принципы устройства бытия, его начала, сущностные формы, свойства и категориальные распределения. gtmarket.ru spravochnick.ru

Прикладная онтология, в свою очередь, применяется в практических целях. en.wikipedia.org Она использует онтологические теории и принципы для изучения сущностей в определённых областях. en.wikipedia.org Назначение таких онтологий — описать концептуальную модель конкретной задачи или приложения. intuit.ru

Таким образом, разница заключается в том, что формальная онтология фокусируется на общих характеристиках объектов, а прикладная — на изучении сущностей в конкретных областях.