Разница между оценкой животных по фенотипу и генотипу заключается в том, что они направлены на оценку разных характеристик животных:

1. Оценка по фенотипу проводится по характеру индивидуального развития животного, на основании живой массы и экстерьерных особенностей в разные возрастные периоды. 1 Она уточняет сделанную ранее оценку по родословной. 1
2. Оценка по генотипу — это оценка наследственных качеств животных, в частности по качеству потомства. 2 Этим методом оценивают как производителей, так и маток, определяя племенную ценность животного. 2

Таким образом, оценка по фенотипу фокусируется на внешних и индивидуальных характеристиках животного, в то время как оценка по генотипу — на наследственных качествах и способности передавать эти качества потомству. 12