В чем заключается разница между корневыми и коренными языками?

Возможно, имелись в виду различия между понятиями «корневые языки» и «коренные языки».

Корневые языки (также называемые изолирующими) — это языки, в которых нет форм отдельных слов, а слова не разложимы на основу и формальные части, представляются сами по себе корнями. dic.academic.ru Значения, которые в других языках передаются формами отдельных слов, в корневых языках обозначаются только формами словосочетаний: порядком слов, частичными словами и интонацией целого словосочетания. dic.academic.ru

Примеры корневых языков: китайский и языки Индокитая. dic.academic.ru

Коренной язык может иметь разные значения, например: изначальный, исконный, постоянный, основной. vk.com

Таким образом, разница между понятиями заключается в том, что корневые языки описывают структурную особенность языков, а коренные языки могут иметь более широкие значения.