Различие в энергетической эффективности агроценозов и природных экосистем заключается в источниках энергии. 13

Природные экосистемы получают энергию только от Солнца. 1 Агроценозы, помимо солнечной энергии, получают дополнительную энергию, которую затрачивает человек на производство удобрений, химических средств против сорняков, вредителей и болезней, на орошение или осушение земель и т. д.. 2 Без такой дополнительной затраты энергии длительное существование агроценозов практически невозможно. 2

Таким образом, энергетическая эффективность агроценозов выше, чем у природных экосистем, так как требует дополнительных энергетических ресурсов для поддержания своей деятельности.

Кроме того, в природных сообществах всё органическое вещество, произведённое организмами, проходит через пищевые цепи, участвует в круговороте веществ и превращается в исходные вещества, в то время как в агроценозах круговорот не замкнут, так как человек забирает большую часть произведённых живыми организмами веществ. 3