Различие между этимологическими и системными паронимами заключается в их происхождении и характере семантической связи:

1. Этимологические паронимы — это слова, возникшие в языке благодаря неоднократному заимствованию из различных источников и изменившие свой вид в результате освоения их в русском языке. 1 Они имеют различное значение в родном языке, несмотря на то, что могли иметь схожее значение в языках, из которых они пришли. 4 Пример: «проект» (задумка, план) и «прожект» (безосновательный замысел). 1
2. Системные паронимы — это слова, объединённые общей семантической связью. 1 У них имеется общий корень, но различные аффиксы (морфемы, служащие для образования новых форм слова — приставки, суффиксы и т. д.). 1 Пример: «гуманный» (человеколюбивый) — «гуманистический» (проникнутый духом гуманизма) — «гуманитарный» (имеющий отношения к гуманитарным наукам или благотворительный). 1