Некоторые различия между археями и бактериями:

• Генетический состав. 1 У архей своя независимая эволюционная история, они характеризуются многими биохимическими особенностями, которые отличают их от других форм жизни. 4
• Среда обитания. 1 Археи часто процветают в экстремальных условиях, таких как горячие источники и кислотные условия, в то время как бактерии могут быть обнаружены в различных средах обитания, включая почву, воду и человеческие тела. 1
• Клеточные стенки. 1 У бактерий в стенках есть пептидогликан, тогда как у архей его нет. 1 Клетки архей чаще всего покрыты белковым S-слоем, защищающим от воздействия стрессовых условий, а в тех случаях, когда клеточная стенка всё-таки присутствует, в её состав входит похожее по структуре вещество — псевдомуреин. 5
• Строение мембраны. 3 У архей липиды эфирные, а бактерий — сложноэфирные. 3 Эфирные связи химически более стойкие, чем сложноэфирные, что помогает археям выживать при высоких температурах, а также в сильнокислых и сильнощелочных средах. 4
• Размножение. 4 У архей оно бесполое: бинарное деление, фрагментация и почкование. 4 В отличие от бактерий, ни один известный вид архей не формирует спор. 4