Проблема определения видов заключается в ряде сложных вопросов, которые возникают у биологов при идентификации и описании новых видов. 5 Вот некоторые из них:

• Как определить, к какому конкретному виду принадлежит организм. 5 Для этого необходимо досконально измерить различные параметры живых организмов и условиться о критериях сходства. 1
• Когда распознавать новый вид. 5 Это вопрос к биологу, который обнаруживает организмы, отличные от тех, что принадлежат к уже описанным видам. 5
• Как определить близкие, внешне сходные виды. 2 Например, существуют так называемые виды-двойники, которые морфологически не отличаются, однако являются генетически изолированными. 2
• Как учитывать постепенность и незавершённость процесса видообразования. 3 Это касается, например, бесполых организмов, для которых вид — это совокупность клонов, объединённых общей экологической нишей и поэтому эволюционирующих совместно. 2

Кроме того, дебаты о видах затрагивают философские вопросы, такие как номинализм и реализм, а также вопросы языка и познания. 5