Принцип комплементарности в матричном синтезе означает, что в двух цепях нуклеиновых кислот, расположенных друг напротив друга, стоят нуклеотиды, которые отличаются азотистыми основаниями. 1
Согласно этому принципу, в молекуле ДНК всегда напротив аденина (А) становится тимин (Т) (они соединяются друг с другом за счёт двойной водородной связи), а напротив гуанина (Г) — цитозин (Ц), которые связаны тройной водородной связью. 1
Принцип комплементарности соблюдается в разных процессах матричного синтеза, например: