Причины возникновения омофонов в языках с традиционной орфографией могут быть разными. Например, в русском языке к ним относятся:

• Оглушение согласных в конце слов и перед другим согласным звуком. 15 Например: «плод — плот». 5
• Редукция гласных в безударной позиции. 15 Например: «отворить — отварить». 5
• Одинаковое произношение неопределённой формы глагола и того же глагола в третьем лице настоящего или будущего времени. 5 Например: «нужно отпроситься — он отпросится». 5

В английском языке омофоны возникают из-за исторически сложившегося разного обозначения на письме одного и того же согласного или гласного звука. 1 Во французском языке — из-за того, что не читаются многие конечные буквы. 1