Некоторые преимущества капельной цифровой ПЦР перед другими методами:

• Высокая точность. 15 За счёт разбавления высокой концентрации ДНК мишени или фона достигается точность определения маленького количества молекул мишени с погрешностью ±10%. 1
• Отсутствие эффектов первых циклов ПЦР. 1 Это уменьшает величину ошибки. 1
• Простой и удобный метод количественной оценки. 1 Не требуется использование калибровочных кривых. 15
• Невысокая себестоимость реагентов на один образец. 1 Это достигается за счёт небольшого объёма реакции (пиколитры-нанолитры). 1
• Возможность обнаружения редких вариантов мишени в сложном окружении. 35 Например, капельная цифровая ПЦР позволяет детектировать и количественно оценивать мутации в концентрациях от 0,0001%. 3
• Устойчивость к ингибиторам. 4 Это позволяет изучать «сложные» образцы. 4
• Высокая производительность по относительно низкой цене. 4 Метод позволяет проводить систематическое тестирование большого потока образцов. 4