Практическое применение метода водного баланса заключается в решении различных гидрологических проблем. 1 Некоторые области применения:

• Оценка водных ресурсов. 12 Результаты исследования водного баланса служат основой для количественной оценки водных ресурсов и их изменений под влиянием деятельности человека. 12
• Планирование эксплуатации водохранилищ. 12 Оперативная информация о водных балансах речных и озёрных бассейнов за короткие интервалы времени (сезон, месяц, неделя, сутки) используется для планирования эксплуатации водохранилищ и составления гидрологических прогнозов. 12
• Управление водными ресурсами. 12 Изучение структуры водных балансов речных и озёрных бассейнов, а также бассейнов подземных вод важно для гидрологического обоснования проектов рационального использования водных ресурсов. 12
• Прогноз изменения водного баланса территории. 4 Метод позволяет предвидеть последствия искусственного изменения водного режима водотоков, водоёмов и подземных вод. 12
• Изучение гидрологического цикла. 2 При наличии данных по водному балансу можно производить сравнение отдельных источников влаги в системе за различные периоды времени, а также установить степень их воздействия на изменения водного режима. 2