Практическое применение метода клеточной инженерии в современной селекции заключается в следующем:

• Ускорение селекционного процесса. 1 Срок получения новых сортов хлебных злаков и других сельскохозяйственных культур сокращается до 3–4 лет (вместо 10–12 лет, необходимых при использовании обычных методов селекции). 1
• Получение гибридов. 1 Метод слияния клеток позволяет создавать гибриды, которые не могут быть получены обычным путём скрещивания из-за межвидовой несовместимости. 1 Например, так получают гибриды различных видов картофеля, томатов, табака. 1
• Оздоровление и быстрое размножение редких, хозяйственно ценных или вновь созданных сортов сельскохозяйственных культур. 1 Например, так из клеток, не заражённых вирусами, получают здоровые растения картофеля, винограда, сахарной свёклы, садовой земляники, малины и многих других культур. 1
• Получение растений, устойчивых к болезням или определённым веществам. 5 Например, таким методом был выведен один из сортов подсолнечника, устойчивый к химическим обработкам, проводящимся для борьбы с сорняками. 5