Практическое применение теории модулей в современной науке заключается в следующем:

• Модульное моделирование механизмов. 1 Компоновка векторной модели механизма из стандартных векторных контуров (модулей) сокращает время и трудоёмкость создания основной кинематической модели механизма. 1 Также использование модульного моделирования позволяет в зависимости от конкретной задачи исследования механизма перейти от основной кинематической к различным расчётным математическим моделям. 1
• Моделирование информационных систем. 2 Модульные сети описывают структуры и содержания компьютерных гипертекстов и веб-сайтов более детально, чем графы. 2 Они помогают проектировать учебные веб-курсы и обучать студентов основам построения математических и визуальных моделей информационных систем и компьютерных программ. 2
• Описание химических молекул. 2 Модульные сети описывают химические молекулы как модульные системы с попарно сцеплёнными валентностями атомов. 2
• Психоаналитическая модель. 5 Учитывает модульную структуру бессознательного и психики в целом, что позволяет видоизменить психопатологические категории с помощью введения представления о специфических компонентах и их взаимодействии. 5