Практическая значимость диофантового анализа заключается в том, что диофантовы уравнения применяются в различных областях, где нужно исследовать сложные дискретные системы. 1

Некоторые примеры:

• Криптография и алгоритмы безопасности. 4 Уникальная природа и сложность диофантовых уравнений делают их идеальными для создания зашифрованных систем, где важно, чтобы решения были неочевидными и трудно поддающимися вычислению. 4
• Молекулярная физика и органическая химия. 1 С помощью диофантовых уравнений ищут оптимальные структуры и подбирают коэффициенты в химических уравнениях. 1
• Алгоритмы обработки видео. 1 Решение диофантовых уравнений возникает в таких случаях, как проектирование осветительных систем (для расчёта стробоскопических эффектов) и разработка систем управления сложными машинами. 1
• Экономика и теория вероятностей. 1 Уравнения такого типа иногда встречаются в этих областях. 1
• Проектирование мостов. 2 Например, знаменитый мост «Золотые Ворота» был построен с применением диофантовых уравнений. 2