Генетическая природа атавизмов у растений заключается в сохранении в геноме древних генов, ответственных за признаки, свойственные отдалённым предкам, но отсутствующие у ближайших, то есть утраченные в ходе эволюции. 12

При нормальном развитии действие этих генов блокируется другими генами (репрессорами). 1 Однако в развитии отдельных особей по различным причинам блокирующее действие может быть снято, и признак проявляется вновь. 1

Пример атавизма у растений — появление 10 тычинок у первоцветов, имеющих в нормальном состоянии 5 тычинок. 12 10 тычинок имели далёкие предки данного растения. 1

Также атавизм у растений может возникать при регенерации утраченных особью органов или при ретардации — задержке онтогенетического развития какого-либо признака на ранних стадиях. 12