Сложности уравнения Шрёдингера заключаются в следующем:

• Отсутствие простых способов решения. 1 Для решения уравнения используются допущения и численные методы, которые позволяют получить характеристику движения частицы во времени. 1
• Недостижимость точного решения для сложных систем. 2 Например, решение уравнения Шрёдингера для многоэлектронных атомов и молекул представляет весьма сложную задачу и требует большого объёма трудоёмких вычислений. 2
• Невозможность объяснить некоторые процессы. 4 Уравнение Шрёдингера не может описывать процесс измерения в квантовой механике, поскольку оно линейно, детерминистично и обратимо во времени, а процесс измерения нелинеен, стохастичен и необратим во времени. 4
• Не учёт релятивистских эффектов. 3 Уравнение Шрёдингера применимо лишь к электронам, более медленным в сравнении со скоростью света, и поэтому не учитывает относительности пространства и времени. 3