Разница в организации тилакоидов у красных и зелёных водорослей заключается в их расположении в матриксе хлоропласта: 24
Таким образом, у красных водорослей тилакоиды лежат в матриксе поодиночке, а у зелёных водорослей их расположение более вариабельное: число тилакоидов может меняться, и они могут быть тесно прижаты друг к другу.